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在开始这篇博文前，让我们先来解释一个名词——实质等同原则。如果对转基因食品(Genetically Modified Food;GM food)各种主要营养成分、主要抗营养物质、毒性物质及过敏性成分等物质的种类与含量进行分析测定，与同类传统食品无差异，则认为两者具有实质等同性，不存在安全性问题；如果无实质等同性，需逐条进行安全性评价。支持转基因食品(Genetically Modified Food;GM food)上市者，一直宣称转基因食品(Genetically Modified Food;GM food)与非转基因食品(Genetically Modified Food;GM food)是实质等同的。
由于转基因食品(Genetically Modified Food;GM food)存在潜在的安全风险，“实质等同”原则其实一直受到人们的质疑。有位朋友推荐我阅读了2014年6月15日发表在Food Chemistry中的一篇文章：Compositional differences in soybeans on the market: Glyphosate accumulates in Roundup Ready GM soybeans（市场上大豆成分的差异：草甘膦在抗农达大豆中的积累）。这里的抗农达大豆就是具有耐草甘膦特性的转基因大豆。这篇文章对美国爱荷华州31个批次大豆中除草剂和杀虫剂的残留进行了测定，并描述了大豆的营养和元素组成。大豆样品被分成三个不同的类别：（1）耐草甘膦的转基因大豆(GM-soy)；（2）采用传统化肥种植方式的非转基因大豆；（3）采用有机耕作方式种植的非转基因大豆。文章得出了一些非常明确的结论：耐草甘膦转基因大豆含高残留的草甘膦和氨甲基磷酸（AMPA，草甘膦在植物体内最常见的代谢产物）（分别为3.3和5.7mg/kg），不同农业耕作方式生产的大豆其营养品质是不同的，有机大豆显示最健康的营养成分，有更多的糖类，如葡萄糖、果糖、蔗糖和麦芽糖，更多的总蛋白质，而含较小的锌和纤维。有机大豆还含有更少的总饱和脂肪和总ω- 6脂肪酸。本研究否定了转基因大豆与非转基因大豆是“实质等同”（substantially equivalent）的。而且，作者还充满信心地说：如果采用35个不同营养和元素变量来描述各大豆样品的话，我们完全能够毫无例外地区分出这三种不同类别的大豆，说明那些准备上市（ready-to-market）的转基因大豆其成分特征与传统种植和有机种植的大豆“实质不等同”（substantial non-equivalence）。
论文很长，在这篇博文中无法全文翻译。但我抽提这篇论文的前言、讨论和结论部分，按照我的理解对文章进行了重新整理，组成了一篇博文。如果对具体的实验设计和数据报道有兴趣，可直接阅读原文。
在全球范围内，耐草甘膦的转基因大豆是转基因作物(Transgenic crops;Genetically Modified Crops)无疑是最多的。除草剂草甘膦是全球使用最广泛的除草剂，2008年生产62万吨。2011年世界大豆产量为2.5亿吨，其中主要生产国美国占33%、巴西占29%、阿根廷占19%、中国占5%、印度占4%。在2011–2012年，种植大豆约3千万公顷的美国，转基因抗农达大豆占93 - 94%。其他主要生产国，巴西和阿根廷转基因大豆分别占83%和100%。在全球范围内，抗农达大豆转基因大豆在2011年占总产量的75%。
第一代耐草甘膦转基因大豆由孟山都(Monsanto)公司开发的专利，在整个生长季节都暴露在草甘膦农药中。在1999年早期对研究中，研究人员当时对转基因大豆的成分分析并不是针对喷洒除草剂的植物进行的。不知道这个错误是无心之过，还是有意为之？不久针对喷洒除草剂的转基因大豆进行再次测试，当时的结果宣称与非转基因大豆实质等同。可是令人惊讶的是，在这些研究中却没有测量除草剂的残留量。按照实质等同的概念，既然宣称转基因作物(Transgenic crops;Genetically Modified Crops)与非转基因传统作物的营养和元素是相似的，有同样的营养成分，因此与传统植物食品一样安全。然而，在鉴定这种安全性的成分研究中忽略（不测量）农药残留则是一个严重的问题。如果存在化学残留，显然是很重要的问题，首先这些化学残留明显是植物组成的一部分，其次它们对最终的植物产品增加了毒性，要么自身添加，要么影响植物的新陈代谢。一般来说，OECD所建议的主要食品和饲料的营养是需要对大豆新品种进行安全评估的，转基因作物(Transgenic crops;Genetically Modified Crops)的风险评估集中于转基因作物(Transgenic crops;Genetically Modified Crops)本身的致敏性和毒性，或者可能带来的意想不到的转化过程所带来的影响。然而，很少关注除草剂残留及其代谢物可能积聚在最终的产品中，以及是否接触这些除草剂或其他与基因改造所导致的本身功能改变（改变了转基因植物(transgenic plant)的中间代谢过程）可能会影响其营养和元素组成。
