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--来自瑞士弗雷德里希米歇尔生物医学研究所(Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research) Dirk Schübeler研究团队和来自巴塞尔大学的Erik van Nimwegen 研究团队开展一项重要的原理循证研究(proof-of-principle study)，结果证实一种计算模型能够阐述细胞分化期间转录调节物和表观基因组动态相互影响。这对于更好地理解不同细胞类型和疾病阶段的性质而言是非常重要的。
三年前，研究人员利用系统生物学方法着手阐述细胞分化期间所发生的全基因组表观遗传事件和转录事件。在多能性干细胞转变为成熟细胞的分化期间，基因表达持续地发生适应性变化。转录因子和染色质局部结构的动态变化一起来调节这种分化过程。在过去几年，在全基因组范围内，对诸如DNA甲基化或组蛋白修饰之类的染色质变化进行绘图已经是可行的。然而，人们仍不清楚的是，如何针对DNA特异性的位点进行染色质修饰。清楚的是基因表达调节涉及转录因子和染色质结构的相互反馈机制：一方面，染色质结构阻止或允许转录因子结合，另一方面，转录因子能够招募蛋白质到DNA上从而改变染色质的结构。这两种过程的相互影响决定着所产生的基因表达模式。
在这项研究中，研究人员重点研究这种分化过程。鉴于存在1500到2000个转录因子，因此在分化期间，在实验上测试每个转录因子对染色质结构所做的贡献是不可能的。为此，研究人员想构建一个模型来描述利用计算生物学预测的转录因子结合位点与染色质结构的全基因范围内的变化之间的关系。
确实，研究人员开发出一种计算模型证实这些实验性研究结果，并且鉴定出几个序列基序调节着神经元分化期间特异性染色质标记的动态行为，而且这些基序能够被转录因子REST和SNAIL家族结合。
这些结果是非常重要的，这是因为它们表明在分化期间，一种阐述全基因组范围内的表观遗传事件和转录事件的系统方法确实是可行的。(
