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西亚试剂:Science:多RNAi进行基因筛选研究

不断的在发展,许多遗传学家仍然在分离检测基因,并且也采用了一些最新的尖端技术, 比如利用RNAi,这种方法通常能获得细胞系统的局部蓝图。

现在来自哈佛医学院遗传学系,英国癌症研究院等处的研究人员拓宽了这种技术的范围:利用RNAi系统敲除果蝇细胞中的许多基因,这一研究成果公布在10月17日的Science杂志上。

文章的通讯作者是HMS遗传学教授,霍华德休斯医学院研究员Norbert Perrimon说,“通过我们的这种新的双RNAi筛选获得数据可以勾画出细胞过程的整体全貌”,“研究人员利用这种方法检测基因之间的相互关系,也许能加速系统生物学的发展步伐, 以及提高个体化用药的发展。”

经典的RNAi选首先需要构建一个靶向特殊基因的干扰RNAs()的文库,每个siRNA能干扰基因产生特定的蛋白,然后科学家们将这些siRNAs转入成百上千的细胞中,每个细胞中一种基因被靶定,之后就可以观察这个细胞中的变化了。但是由于许多基因并不是只有一个,细胞失去一个基因的功能,能通过其它基因补充回相同的功能,因此这种方法有时不能捕捉一些关键因子,而Perrimon的方法可以克服这一障碍.

文章的第一作者,Perrimon实验室的博士后,Chris Baka解释道,“如果你拿去飞机引擎上的一个零件,飞机仍然能够工作,但是如果你将清除故障的也一同拿去的话,那么飞机就不能工作了”。

Baka1开始的时候用传统的RNAi筛选方法,对在细胞胁迫反应中起作用的基因进行研究,结果获得了一些有助于细胞决定死亡,移动, 以及在胁迫环境下采取其它一些手段的基因。但是Baka1发现其中的一些关键基因——其它实验室通过其它方法识别的基因——在他所获得的基因中没有。然后他从中挑选了12个“嫌疑犯”,其中包括了抑癌基因PTEN ,BAKAl敲除了PTEN,用得到的敲除细胞去进行另一个RNAi筛选,这样就是一个缺乏一种抑癌基因的环境下进行的筛选,获得结果与上次的完全不同:他获得了其它11个嫌疑基因(除了PTEN外),最终他总共验证了同一个细胞类型中17724个不同的关联。

Bakal说,“基因的行为是否有不同,依赖于基因之间的关联”,“我们的方法强调了基因之间的相互关系,述说了一个完整的故事。”

这些相关数据表明了特殊基因是如何相互作用的, 以及它们是如何相互影响的,Bakal认为研究人员可以利用这种方法描绘细胞系统的工作,预计特殊基因的行为,从而用于个体化用药。临床医师在决定治疗策略之前需要了解病人的遗传背景,未来医师们可能可以利用到双RNAi筛选结果。(