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西亚试剂:Nature:ncRNA具有促进DNA转录功能

日本RIKEN高级科学研究所分子和细胞生物学实验室,东京大学研究生院生命科学院,麻省波士顿学院生物学系,京都大学研究生医学院遗传学系的科学家发现非编码RNAs的级联转录过程是改变染色质的过程。相关的成果公布在11月6日出版的Nature期刊上。

最近采用高通量的tilling arrays技术对转录子开展大规模的研究,并对整个cDNA文库进行分析(FANTOM3 consortium),分析结果表明,大部分的转录产物都是非编码RNAs(non-codingRNAs,ncRNA)。对这些转录子进行分析发现这些先前认为没有功能的RNA其实是转录的活性区域,具有多种转录活性特征。并且,研究发现大部分的长片段(上千kb)实际上是转录mRNA的活性位点。目前,绝大多数的ncRNA的功能都不为人所知,甚至有多种争论,人们对它的功能意见不一。

研究者对裂殖在转录期间位于fbp1+转座子区域的RNA聚合酶II的ncRNA进行研究。结果发现染色质fbp1+区域日益变成一个开放性的构型,几种不同的ncRNAs都由这一区域转录而来。这些ncRNA与RNAPII在fbp1+转录起点的上游区域一一配对。如果在上游区域插入一个转录终止子,将导致ncRNA转录停止,染色质停止改变。

研究者的结论是,转录的过程是要促进DNA序列接近转录激活因子和RNAPII的过程