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由抑制性微RNA()诱导的基因沉默在调控基因表达中的重要性现已非常明显。但因为一个信使RNA(mRNA)的miRNA调控在它们的序列中只需要有一个短的匹配段(长度为8个核苷酸或更少),所以事实证明,要明确确定所预测的很多mRNA结合点中哪个是每个miRNA在活体中的目标几乎不可能。
现在,对HITS-CLIP方法所做的一种改进(这种改进的方法以miRNA和 mRNA与Argonaute蛋白的相互作用为关注点;Argonaute蛋白是普遍存在的核酸内切酶,它们形成由RNA诱导的沉默复合物的一部分),被用来解析miRNA与大脑mRNA转录体的结合点的一个精确分布图。该方法具有普遍适用性,应能为了解miRNA在生物学中的作用提供了一个新手段。
另外,这种分布图可让研究人员确定具有临床意义的mRNA上用于RNA干涉(RNAi)疗法的目标作用点