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他的团队设计了一种方法来观察那些自从两个种系分开之后新的基因在人群中扩展的那些现代人的基因组区域。 这些基因可能在某种程度上提高了早期人类的生存或繁殖的机会。
研究人员对来自世界各地的5个现代人的基因组进行了筛检，旨在寻找在人类中经常发生但在尼安德特人中却不发生的基因序列变异的基因组区域。 他们发现212个有这种变异的区域。 在20个区域中，有着最强的正向选择证据的是3个基因，当它们发生突变的时候，可影响思维和认知能力的发展。 这些基因被认为与Down综合症、精神分裂症和自闭症有关。
在这一20个区域的名单上，还有一些区域包括了一个与能量代谢有关的基因以及另外一个可影响头盖骨、锁骨和胸腔发育的基因。
研究人员还用尼安德特人的基因组制作了存在于所有当今人类但却在尼安德特人或猿中没有发现的首个版本的基因特征目录。这一目录对那些研究是什么将人类与其它生物区隔开来的科学家来说是很有价值的。
在该期杂志所发表的一篇配套文章中，另外一个研究团队（其中有许多作者与前一篇文章的作者相同，而且该文也是由P??bo所主导的）介绍了一种对尼安德特人基因组的选择区域（特别是那些来自已经降解的尼安德特人遗骨）进行测序的新技术。文章的作者应用一种“目标序列捕捉”的方法来加强他们对来自西班牙的另外一个尼安德特人个体的基因组中的数个片断的蛋白编码区域的聚焦。他们发现了88个替代氨基酸，这些氨基酸在我们与尼安德特人分开之后已经成为固定的状态。有必要做进一步的研究以确认这些变化是如何影响人类生物学的
