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西亚试剂 :Cell子刊:一种新的调控宿主抗病毒反应的长链非编码RNA——NRAV

中科院微生物研究所、福建农林大学的陈吉龙研究员长期从事流感病毒致病机理、抗病毒免疫学、病毒感染诱导肿瘤发生机理、肿瘤免疫学等领域的研究。

近期,其实验室利用Arraystar Human LncRNA 芯片研究发现了一种新的调控宿主抗病毒反应的长链非编码RNA——NRAV,通过抑制干扰素刺激基因转录从而调控抗病毒反应,在抗病毒天然免疫反应中发挥重要调控功能。该研究成果刊登在Cell, Host & Microbe(影响因子12.194)。

研究背景:

流感是一种重要的人畜共患传染病,极具感染性和传染性。流感病毒感染宿主后,病毒RNA被宿主的病原识别受体所识别,激活抗病毒天然免疫应答,抑制病毒复制。

LncRNA是近5年来生物和医学界的热门研究领域,已有报道证明lncRNA在众多细胞过程中具有重要功能,但是lncRNA在抗病毒天然免疫应答过程中的作用目前仍不清楚。

陈吉龙教授课题组本次研究目的是利用Arraystar Human LncRNA 芯片对lncRNA在流感病毒复制及宿主抗病毒天然免疫应答中的功能展开系统研究。

研究思路:

为了系统检测病毒对宿主lncRNA的影响,作者首先应用美国Arraystar Human LncRNA芯片检测甲型流感病毒(IAV)感染和不感染的肺泡上皮细胞细胞(各3例)的lncRNA表达变化。其中,lncRNA-NRAV在IAV感染的细胞中表达水平显著降低,并且借助于生物信息学分析和分子生物学手段,确认了NRAV的非编码特征和全长序列。

作者通过细胞和转基因小鼠的体外、体内实验表明,NRAV能够显著促进IAV的复制及毒力,说明NRAV是抗病毒天然免疫应答的负调控因子。

作者进一步研究NRAV促进IAV复制的机制,在病毒感染的细胞中过表达NRAV,通过全基因组表达谱芯片检测基因表达改变。GO分析显示很多差异表达基因与病原体感染和病毒复制有关,并且众多干扰素刺激基因的基因表达发生显著变化。

作者在多个层次研究NRAV影响干扰素刺激基因表达的机制。ChIP-PCR实验发现,NRAV显著改变关键干扰素刺激基因IFITM3和MxA的启动子区的组蛋白修饰水平,从而抑制IFITM3和MxA的基因转录。进一步,通过RNA pull-down和RIP实验还发现,NRAV特异性地与多功能转录因子ZONAB相结合,二者相互作用,从而影响MxA的转录调控。以上资料由西亚试剂http://www.xiyashiji.com/提供