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2016年3月17日,国际著名学术杂志《Cell》子刊、植物学科领域国际重要期刊《Molecular Plant》杂志在线发中国农业科学院水稻所王克剑研究员领衔的染色体工程及基因组编辑创新团队发表的一项研究成果,研究人员通过对Cas9蛋白进行定点修饰,成功将水稻基因组内可编辑范围拓展到现有的2倍以上。硕士生胡熙璕、王春助理研究员和付亚萍副研究员为共同第一作者,王克剑研究员为通讯作者。
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CRISPR-Cas9系统以其简便、高效的技术特点,迅速成为植物中最为广泛使用的基因组编辑手段,为种质资源创制以及基因功能研究等工作提供了极大的便利。CRISPR-Cas9系统在基因组上的精准切割需要特异识别一段称作为PAM的邻近核苷酸序列。目前植物中最为广泛使用的SpCas9能够识别的PAM序列局限为经典的NGG,这严重限制了Cas9的可编辑范围。为突破这个限制,科学家们在动物及微生物中进行了不懈的尝试并获得了一定的进展,然而在植物中尚未有成功的案例报道。
该创新团队通过定点突变的方法对水稻中广泛使用的SpCas9蛋白进行了改造,获得了两种Cas9 变体(VQR,VRER)。通过一系列的转基因实验证明,两种Cas9变体在水稻中分别可以识别NGA以及NGCG两个PAM序列。生物信息学分析表明Cas9变体的创制将使得CRISPR/Cas9系统在水稻中可编辑范围拓展到现有的2倍以上。此外,两种变体也可以同时对多基因进行有效的编辑,表明其与野生型Cas9一样具备巨大的应用潜力。因此,该工作为在水稻中进行更广泛的基因组编辑提供了新的可选工具。以上资料由西亚试剂:http://www.xiyashiji.com/