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这种新方法采用最新开发的一种技术,称为单细胞RNA-seq,这种技术可测定来自一个单细胞的信使RNA。这些RNA统称为转录组,显示一个给定的时间点上,细胞内的哪些基因转录活跃(即复制成信使RNA,用于建造蛋白质)。例如,这有助于科学家们理解,是什么使皮肤细胞与心脏细胞如此的不同,即使这些细胞共有相同的DNA。
Kimmerling说:“科学家们已经构建了一种方法,用于解决各种不同的细胞群,但是有一点不明确:这些多样性是如何产生的?这是我们面对的关键问题:一个单一的细胞如何会产生如此不同的后代?”
为了回答这个问题,研究人员设计了一种微流体装置,可捕捉单个细胞,然后捕获它所有的后代。该装置有几个连接通道,其中每个通道都有一个陷阱,可捕获一个细胞。在最初的细胞分裂之后,子细胞沿着这一装置流动,并被困在下一个通道中。研究人员表明,他们能够以这种方法,捕获多达五代的细胞,并记录它们的关系。
为了使细胞从芯片脱落下来,研究人员暂时颠倒了流体经过芯片的方向,从而使他们能够一次性地清除细胞,以进行单细胞RNA-Seq。
在这项研究中,研究人员捕获了称为T细胞的免疫细胞,并对其进行测序。这些细胞在体内不断的发出警报,当它们遇到一个被病毒或细菌感染的细胞时,它们就开始行动,从而产生两个不同的群体——效应T细胞,它们寻求并破坏受感染的细胞,和记忆T细胞,它们保留了体内的遭遇和循环的记忆。
Kimmerling说:“一个单一的建立者细胞可以产生效应细胞和记忆细胞的亚型,但这种多样性是如何产生的,还不是很明确。”
研究人员分析了最近激活的T细胞及其2个后代的RNA。当比较具有与T细胞活化和分化相关功能的基因时,他们发现,与其他两个不相关的细胞相比,从相同分裂事件产生的“姊妹”细胞,它们的基因表达谱更加相似。他们还发现,与无关的细胞相比,“表亲”细胞——有相同的“祖母”,也更加相似,这表明单个T细胞具有独特的、谱系特异性的转录模式。以上资料由西亚试剂:http://www.xiyashiji.com/