西亚试剂 :Nat Commun： 新平台让单细胞RNA-seq进一步升级

2016年2月18日，国际著名学术杂志《Cell》子刊《Cell Reports》杂志在线发表浙江大学生命科学研究院宋海卫实验室题为“Structural and Functional Insights into the Unwinding Mechanism of Bacteroides sp Pif1”的研究论文。博士研究生周香莲，博士毕业生任文丹以及新加坡IMCB研究所研究员Bharath为论文共同一作者，宋海卫教授为论文通讯作者。

Pif1是解旋酶SF1B超家族的成员，能够利用ATP水解提供的能量，对双链DNA, DNA/RNA杂合体，G4 DNA进行解旋。Pif1是个多功能蛋白，参与了细胞中很多生物学过程。Pif1可以通过将端粒酶模板RNA与端粒DNA解链，使端粒酶从端粒游离下来，从而调控端粒的稳定性。在复制及转录过程中，Pif1能够迅速解开G4结构，维持基因组的稳定性。Pif1还参与了冈崎片段的成熟及DNA损失修复的BIR途径。宋海卫实验室以拟杆菌BaPif1为研究对象，用结构生物学方法解析了BaPif1和人类hPif1 Helicase Domain的单体结构，以及BaPif1与两种不同单链DNA的复合物晶体结构。研究发现Pif1结合DNA后，构象发生了变化，尤其 2B domain的变化对Pif1行使功能至关重要。而且，Pif1的signature motif并没有直接与DNA相互作用，而是形成一个α螺旋支撑wedge region间接行使其功能。通过将Pif1与带5’ 端 poly dT尾巴的双链DNA进行共结晶，在晶体结构中意外的发现只剩一条DNA，并且单链DNA在ssDNA/dsDNA junction的位置发生近90°的弯曲。通过分析这一系列结构，揭示了Pif1解旋的可能分子机制。以上资料由西亚试剂：http://www.xiyashiji.com/