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西亚试剂:Nanog基因上CDK9/KLF4的ChIP-Seq结果

之前已有研究表明,P-TEFb复合体会通过其催化亚基CDK9,磷酸化RNA Pol II,比较ESCs和MEFs,研究发现ESCs中CDK9表达量更高,RNA-Seq数据表明,如果在MEFs中沉默CDK9,会明显下调多能性基因表达,包括其著名靶基因Hexim1。在很多细胞中,CDK9都会与HEXIM1组成复合物,保持失活状态,由于另一个蛋白BRD4会通过去除HEXIM1激活CDK9,研究者进一步探索了MEFs重编程过程中BRD4和HEXIM1的角色,通过构建靶向BRD4的shRNA、过表达载体及不同的BRD4及CDK9突变体,利用ChIP-Seq实验,研究者发现,BRD4会增强RNA Pol II的Ser2P修饰水平,强烈结合于多能性基因启动子区域,诱导多能性基因表达。这些结果证实,BRD4的确可以代替HEXIM1与CDK9互作,激活CDK9,促进多能性基因的表达,是重编程的一个正向调节因子,而HEXIM1则会发挥与BRD4相反的作用,它会阻止多能性基因表达,是重编程过程的一个障碍。

由于CDK9需要转录因子帮助才能在特定位置结合,修饰RNA Pol II,为了鉴定MEFs中介导CDK9富集的转录因子,研究者将OSKM四个重编程因子转入HEK293T细胞内,通过免疫共沉淀及ChIP-Seq数据分析,证实KLF4会与CDK9共同结合于多能性基因启动子区,对RNA Pol II进行修饰,改变其暂停状态,诱导多能性基因开始转录。

至此,研究者确认了细胞重编程过程中一条完整的调控通路,在该通路中,不同调控因子相互作用,通过RNA Pol II的磷酸化水平,促使其在多能性基因启动子区域由“暂停”状态进入“延伸”状态,诱导这些基因转录。对此通路的研究,有助于人们更好地理解细胞命运如何发生变化,显著提高体细胞重编程的效率,同时也对诱导多能干细胞在治疗重大疾病如帕金森、心血管疾病等方面的应用研究具有重要意义。

 

 

 

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