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10月10日, Cell Stem Cell在线发表了中国科学院广州生物医药与健康研究院Miguel A. Esteban课题组关于体细胞重编程调控的最新研究成果。
2012年,日本科学家山中伸弥凭借其所发明的诱导多能干细胞技术(induced pluripotent stem cell,iPS)荣膺当年诺贝尔生理及医学奖。该技术通过诱导成熟体细胞某些特殊基因表达,将其逆转为具有各种发育潜能的干细胞,这个过程也被称作细胞重编程。iPS克服了胚胎干细胞带来的伦理问题,在细胞治疗和器官移植方面具有巨大的应用潜能,受到了人们的广泛关注。
在后生动物基因转录调控网络中,RNA Pol II是转录起始的一个关键步骤。本项研究中,研究者选择鼠胚胎成纤维细胞(mouse embryonic fibroblasts, MEFs)这种分化程度较高的细胞作为研究对象,试图通过比较体细胞、重编程过程中的细胞、胚胎干细胞(embryonic stem cells,ESCs)三类细胞中RNA Pol II在基因上的分布情况,了解细胞重编程过程中多能基因网络调控机制。通过分析已有的GRO-Seq(Global Run-On Sequencing)数据,研究者发现,在ESCs中,Pol II在近启动子区域“暂停”状态比MEFs要多,并认为在ESCs中,多能性基因的转录调控与MEFs有所不同。通过对OSKM(OCT4、SOX2、KLF4、和c-MYC)重编程处理后的MEFs进行ChIP-Seq检测,研究者发现,随着重编程时间延长,RNA Pol II会越来越多地暂停在近启动子区域,阻止一些关键多能性基因的表达,进一步阻碍重编程过程。

MEF重编程过程中Oct4基因RNA Pol II结合情况

突变CDK9后对重编程MEFs进行RNA-Seq结果

BRD-CTD处理后四个基因上Pol II及Pol II Ser2P的ChIP-qPCR结果,结果显示,BRD-CTD增强了Pol II在基因主体上的结合。
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