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西亚试剂:二代测序技术分析了脂肪肉瘤

Peter MacCallum癌症中心、Walter and Eliza Hall医学研究所和Garvan医学研究所的科学家们,用二代测序技术分析了脂肪肉瘤的neochromosome。他们通过计算模型,重建了neochromosome形成时的一系列事件,找到了这种畸形染色体的来源。文章的通讯作者是David Thomas教授和Tony Papenfuss副教授。

在Papenfuss眼中这项工作就像是考古,通过翻找灾难性事件的遗迹,来理解事件的发生过程。

“研究显示,12号染色体破碎产生的碎片,随机形成了环状DNA,”他说。“随着细胞分裂的进行,这个环状染色体复制并进入其他细胞,成为一种持续性的改变。后来小环逐渐变成了大环,有选择的扩增特定基因。这个慢慢生长的怪物,吸取了基因组各部分的DNA。在某个特定的时间点,DNA环停止生长并成为线性。这时我们在显微镜下观察肿瘤细胞,就会看到巨大的线性染色体。”

这个过程中的基因重排规模是很惊人的,“癌症巧妙操纵正常的复制过程创造了一个庞大的怪物,选择性获取和扩增有利于自身发展的基因,” Thomas教授说。“一些脂肪肉瘤细胞系的neochromosome,拥有来自每个染色体的DNA,关键癌基因可以达到50-100拷贝。类似的基因重排事件也发生在患者的肿瘤之中。”

这项研究鉴定了脂肪肉瘤的潜在治疗靶标,“当关键癌基因的大规模扩增被阻断时,癌细胞就会死亡,”Thomas教授说。

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