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西亚试剂:Droplet Barcoding for Single-Cell Transcriptomics Applied t

两个研究小组各自开发了一些方法利用微珠将大量不同的DNA条形码同时传送到几十万纳米大小的液滴中。两种方法都利用了微流体装置来将细胞和微珠一起装入这些液滴中。这些液滴是在一个小型装配线上生成,沿着一根头发宽的槽道流动。

微珠条形码附着到每个细胞的一些基因上,因此科学家们可以一批次测序所有的基因,追踪每个基因的来源细胞。Macosko和Klein采用不同的方法生成了他们的微珠。液滴在这个过程中按不同的步骤破裂。其他的一些化学方面也有差异。但结果是一样的。

Klein说:“通过dro-seq或inDrops运行一个批次的细胞,科学家们就可以看到整个样本中表达了哪些基因——并可以按每个细胞进行排序。”

然后他们利用计算机软件揭示混合物中的一些模式,包括哪些细胞具有相似的基因表达谱。这提供了一种方法来分类原始组织中的细胞类型——并有可能发现新的细胞类型。

当前的一些方法可以让研究人员一天以数千美元的成本生成96个单细胞表达谱。相比之下,dro-seq每天只需6.5美分就可生成1万个单细胞表达谱。

不同的目标

McCarroll、Macosko和同事们当前正利用dro-seq兴奋地探索大脑。Kirschner、Klein和同事们则对包括干细胞发育在内的其他领域非常感兴趣。

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