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来自北京生命科学研究所(NIBS)的研究人员报告称,他们证实在拟南芥中剪接因子PRP31参与了转录水平上的基因沉默及胁迫反应(延伸阅读:北大长江学者Science揭示基因沉默新机制 )。他们的研究发布在7月6日的《分子植物》(Molecular Plant)杂志上。
DNA甲基化是从细菌到人类最普遍的一种表观遗传修饰方式。DNA甲基化修饰在基因表达、细胞分化以及系统发育中起着重要的调节作用。尽管当前众所周知,DNA甲基化与基因的转录失活,尤其是转基因的失活、转座子(TEs)的转移失活等多种表观遗传基因的失活存在着密切的关系,对于DNA甲基化非依赖性的转录水平基因沉默机制仍知之甚少。
一些研究表明,RNA介导的DNA甲基化(RdDM)是DNA脱甲基酶缺陷的拟南芥ros1突变体中RD29A-LUC转基因沉默的必要条件。在ros1/ago4双突变体植株中,编码RdDM 核心元件的ARGonAUTE 4 (AGO4)基因丧失功能可部分解除RD29A-LUC沉默。以往何新建课题组采用正向遗传学筛查以ros1/ago4突变体为背景,鉴别出了RD29A-LUC转基因表达升高的突变体。发现了一个PRP31同源基因突变。PRP31编码了一个保守的前体mRNA(pre-mRNA)剪接因子,调控了真菌和动物中的U4/U6.U5 snRNP复合物形成。此外,他们还曾证实剪接因子ZOP1和STA1促成了转录水平上的基因沉默。
在这篇新文章中研究人员揭示,拟南芥PRP31与ZOP1、STA1和几个剪接相关蛋白结合在一起,表明这些剪接因子在物理及功能上有关联。他们证实拟南芥PRP31参与了转录水平的基因沉默。并且PRP31、STA1和ZOP1是发育和胁迫反应的必要条件。在低温胁迫下,PRP31不仅对前体mRNA剪接至关重要,也调控了低温反应基因表达。
这些研究结果表明,剪接机器在前体mRNA剪接、基因调控、转录后基因沉默和胁迫反应中发挥了多重功能
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