西亚试剂：上海交通大学吴强教授团队发表DNA“组装”成三维基因组立体结构与基因调控研究成果

2015年8月14日，《Cell》杂志发表了上海交通大学系统生物医学研究院比较生物医学研究中心吴强教授团队题为《通过CRISPR遗传编辑技术反转CTCF位点改变基因组拓扑结构和增强子与启动子功能》的研究论文。该研究阐明了从一维基因组线性DNA元件“组装”成三维基因组立体拓扑结构的自然规律以及其调控基因表达模式的分子机制。

系统生物医学研究院吴强课题组前期建立了比较生物医学研究平台，能够高效、快速、精确地对小鼠基因组DNA片段进行遗传编辑，包括反转基因调控元件、敲除基因簇、重复DNA片段等，可以研究基因表达调控机理和蛋白质在体功能(Li et al., JMCB., 2015; Jia et al., MCB., 2014)。本研究建立在前期工作基础上，主要由博士研究生郭亚和硕士研究生许泉同学在吴强教授的指导下完成，研究团队其他成员在实验过程中积极参与协作，并做出重要贡献。本项目研究和发表过程中得到陈竺和张杰的关心。本研究还得到哥伦比亚大学、冷泉港实验室、加州大学圣地亚哥分校、清华大学和德克萨斯大学达拉斯分校的合作，并受得科技部和基金委资助。

DNA在细胞核中被有规律地“组织”起来形成立体的三维结构，这种组织结构提供了基因表达调控以及细胞发育与分化的结构基础。但这种复杂却很有规律的三维结构是如何被建立起来的呢?近日，上海交通大学吴强课题组给出了一个关键的答案。

该研究发现一种被称为CTCF的绝缘子结合蛋白识别其靶向DNA序列是具有方向性的，这种蛋白质识别DNA的方向性决定了染色质环化的方向性，从而形成染色质高级拓扑结构域，进而“辅助”一维线性的DNA元件“自组装”成立体的三维基因组，并调控基因表达，可能与多种人类疾病相关。日前，国际自然科学领域三大期刊之一的《细胞Cell》杂志发表了该研究成果，并获得专项评论

以上资料由西亚试剂：http://www.xiyashiji.com/ 提供