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在全蛋白质组的尺度上阐释多蛋白复合物的构成成分得到了用于系统性确定蛋白-蛋白相互作用的高吞吐量方法的帮助。在这项研究中,Edward Marcotte及同事,基于对固有可溶大分子复合物的生物化学分级、再通过串联质谱来识别构成成分的方法并行识别来自九个物种的蛋白复合物。他们获得的数据(来自蛔虫、小鼠、海胆、人类、青蛙、苍蝇、海葵、粘菌和酵母)显示,很多复合物在不同物种间是保守的。通过将这些结果与基因组测序信息相结合,本文作者得以能够预测122种真核生物的超过100万个相互作用。
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