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加州大学发布测定酿酒酵母中的单细胞蛋白丰度新方法
很多DNA变体通过改变一个或几个基因的表达水平来影响表现型,因此人们目前对标绘这些“表达量化性状位点”(eQTL)很感兴趣。
这篇论文介绍了一个新的eQTL标绘(mapping)方法,它设计用来克服现有方法的局限性(现有方法所关注的是RNA或蛋白丰度)。该新方法依靠GFP(绿色荧光蛋白)标记来测定酿酒酵母中的单细胞蛋白丰度。
然后,混合测序(Pooled sequencing)方法被用来对数千个蛋白丰度高和蛋白丰度低的人的整个基因组中的等位基因频率进行比较。
作者发现,对一个给定的基因来说,在影响mRNA和蛋白丰度的等位基因(位点)之间存在密切对应关系,同时他们也识别出了影响多个蛋白的热点位置——后者对基因调控网络有深远影响。
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