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BRCA1是一个抑癌基因,能够在某些情况下,将一个细胞转变为肿瘤类型。测量一个细胞中BRCA1 mRNA剪接变体的数量,可以显示这个基因是否正在表达,这是乳腺癌一个可能的迹象。
但是,目前检测癌症的方法,都依赖于数百或数千个细胞所组成的样本,不能提供癌症相关基因如何在单个细胞内表达的详细信息。
普渡大学的农业和生物工程教授Joseph Irudayaraj和他的研究小组,首次检测和量化单个细胞中的BRCA1 mRNA剪接变体——当mRNA形成时被移除的遗传物质片段。剪接变体可以决定一个细胞的命运,以及特定蛋白是如何表达的。剪接过程中出现的错误与各种疾病有关。
他说:“利用这种方法,我们基本上能够海里捞针,并且我们可以确定海里是有5根针还是50根针。”
Irudayaraj和他的研究生助理Kyuwan Lee——该研究的第一作者,改造普遍纳米技术方法,来应对“活细胞中mRNA剪接变体的精确定位”这个挑战。他们制备了金纳米粒子——比人的一根头发直径小1000多倍,并用与BRCA1 mRNA 剪接变体互补的DNA链标记它们。
当注入细胞后,纳米粒子就附着于BRCA1 mRNA 剪接变体的任意一端,形成被称为二聚体的结构,Irudayaraj称,这种结构就像“一对手拉手的情侣”。
因为当二聚体遇见光时,会发出一种独特的信号,因此,研究人员就能够通过利用一个简单的光源照射细胞,来测量二聚体的数量。一个细胞中二聚体的数量,与BRCA1 mRNA剪接变体的数量相对应。
当光照在一个金纳米粒子上时的表现有所差异,从而可让研究人员能够将二聚体和自由浮动的金粒子区别开来。
研究人员用两种方法来量化二聚体:光谱法,测量遇见一个物体时的光散射方式,和一个比色图像,在上面二聚体显示为红色的点,而单个金粒子则呈绿色。
该技术可以在大约30分钟内,量化单个细胞中的mRNA剪接变体。Irudayaraj正在修改系统,以加快这个过程,以便其可以用于组织活检。他说:“如果我们能够在组织活检中以单细胞分辨率量化关键的mRNA,对于重要疾病的治疗方案改善来说,将非常的强大。”
Irudayaraj称,该技术还能够提高我们对于细胞生物学的理解,为基于单细胞的遗传分析和诊断铺平了道路。
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