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测序肿瘤细胞基因组揭示出了成千上万与癌症相关的基因突变。然而,要对这样海量的信息进行筛查从中找出真正驱动癌症生长的突变,已被证明是一个繁琐且费时的过程。
来自麻省理工学院(MIT)的研究人员,现在开发了一种方法在小鼠体内模拟这些基因突变的效应。他们的方法是基于一种叫做CRISPR的基因组编辑技术,其速度比要求构建出携带致癌突变遗传工程小鼠的现有方法速度要快得多。相关研究论文“Contrasting roles of histone 3 lysine 27 demethylases in acute lymphoblastic leukaemia”发布在10月22日的《自然》(Nature)杂志上。
论文的主要作者之一、麻省理工学院Koch综合癌症研究所博士后Thales Papagiannakopoulos说:“这是一种极其快速且适应性非常强的建模方法。拥有大量的突变,我们却不知道它们在肿瘤进展中所起的作用。如果我们能够真正地了解生物学,那么我们就可以去尝试靶向性的治疗方法。”
在Papagiannakopoulos,论文的另一位主要作者、研究生Francisco Sanchez-Rivera,以及论文的资深作者、Koch研究所主任Tyler Jacks的领导下,该研究小组利用CRISPR精确地重现了两个众所周知的肺癌基因的效应。他们还模拟了叫做一个APC的基因,以往人们并不知道APC在肺癌中起作用。
研究人员说,这种方法可用于研究许多不同癌症类型中几乎所有的基因。Sanchez-Rivera说:“必须要有一种有效的方法来评估测序研究中发现的这些候选癌基因的作用。我们开发的这一系统直接填补了这一空白,你可以非常快速、非常精确地做到这一点。”
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