西亚试剂：从新手开始

很多IPython笔记本用户都是技术丰富的程序员，但是专家正在帮助新手使用该软件。大约3个月前，加州大学圣地亚哥分校博士后Yan Song在电脑程序使用方面还没有任何经验。她在分子医学实验室进行细胞研究，包括设计实验、收集数据，而另一位计算机科学家则帮助她挖掘数据。

当他们区分各种神经元时，Song的任务是找出老鼠和人类干细胞中RNA表达发生的变化。以前，她使用Excel对比不同阶段的细胞组织的表达模式。今年早些时候，她开始要检测单个细胞以及细胞大小与复杂的RNA序列数据。她的研究不再像以前一样仅仅分析几组细胞数据，而是一次性对上千个细胞进行对比，每次要检测大约1500个和神经发展相关联的基因。

该实验室生物信息学专业研究生Olga Botvinnik于是在IPython笔记本中生成研究结果，这样Song可以对这些代码进行分析。出于好奇，Song说：“它看起来是一个非常容易操作的界面，你可以给一行信息进行编码，然后立刻检验它是否正确。”

通过在线课程和信息专栏的帮助，仅用了数周时间，Song就学会了一些基本的IPython编程技术，Botvinnik还列了一些菜单，让Song用不同的聚类算法研究她的数据。尽管目前Song还要依赖Botvinnik的帮助进行大量运算和分析，但她表示自己已经开始动手分析数据，并用掌握的生物学知识检验一些特别的细胞或基因子集，在未来分析中她也在教Botvinnik这种方法。“以前我们俩用两种不同的语言交流，我用生物学语言，而她用编程语言。现在，我们有了共同的基础，可以更好地进行交流。这将加速我们的研究。”她说。

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