西亚试剂：代码应用

在得克萨斯大学奥斯汀分校，Tal Yarkoni利用IPython笔记本在大脑图像研究中进行自动化元信息分析，以发现参与语言过程、情绪变化以及其他大脑神经活动过程的模式。这位心理信息专家计划把他的笔记和未来的论文一起发表。“分析越复杂，用一份完整的记录来涵盖和传递这个过程就越重要。”他说。

事实上，已经存在与IPython笔记本相似的各种代码语言应用程序。比如在数学家中很受欢迎的商业分析软件包裹Mathematica 和Maple就包含笔记本或类似笔记本的应用程序。 在信号处理、工程以及医疗图像研究等领域使用量极多的商业分析包裹MATLAB也支持笔记本应用。而每种笔记本都有其相应的专业代码语言。

在开放性资源领域，有很多笔记本和类似笔记本的程序。如knitr 使用的是R代码语言，具有强大的数字分析能力;Sage数学软件系统同样基于Python语言，还支持其自带的笔记本;Dexy是一个类似笔记本的程序，专门帮助用户合并短文、代码、数据和其他媒介中的信息，生成论文和讲稿。

但Dexy创始人Ana Nelson却表示，IPython笔记本是其中应用最广的程序。“很多没有听说过其他应用程序的人都知道Ipython。”她说。不过，Granger 和Pérez并不知道有多少人在使用他们的软件，他们仅表示主动使用该程序的用户访问其网站的次数大约在50万~150万人之间。Nelson表示，这是至今为止设计得最好的数字笔记本，其免费性及开放性吸引了很多用户。该应用程序还因Python代码语言受大众欢迎而获益，因为该编程语言在科学界拥有广大的使用群体，他们会每年就此举行国际会议，而且该语言对于入门程序员来说相对简单易学。

尽管随论文一起发表研究笔记的研究人员越来越多，但是让科学期刊把这些资料作为完整的期刊文章的一部分来发表，还需要很长的过程。而目前一些IPython笔记已经作为书籍出版，很多教授还用这个软件开展互动课堂。但到目前为止，这些笔记仍仅作为论文的附属品来发表，经常被用来提供分析代码和附加解释的选择手段。

“出版商仍然不认为他们需要整个研究过程。”Granger说。这些数据的版式可能过新，很难让期刊把笔记本作为正式的文档版本，如html或pdf版本。但是IPython已经开始和一些出版商就此对话。

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