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真核生物的染色体复制是有时间顺序的,人们将其称为复制时间程序(replication-timing program)。在哺乳动物中,复制时间存在着细胞类型特异性。而且在发育过程中,至少有半数基因组会发生复制时间的改变。这种改变主要是基于400–800kb的单元,即复制结构域(replication domain)。
现在,佛罗里达州立大学的一项新研究首次确定了这些单元的边界,文章发表在11月19日的Nature杂志上。这一成果将帮助人们进一步理解复制机制和相关疾病,比如癌症。
David Gilbert教授和博士后Ben Pope领导研究团队,深入分析了细胞核中的遗传物质复制。他们的工作是大型项目ENCODE的一部分,该项目在本期Nature杂志上连发四篇文章,综合比较了小鼠和人类基因组的异同。
之前的高分辨率染色体构象俘获研究(Hi-C)发现,复制时间的早和晚对应着三维染色质隔间(chromatin compartment)的开和关。而这种染色质隔间中还存在着亚结构,即拓扑相关结构域TAD。这个结构在不同细胞类型中相当保守,而且其大小与复制结构域相当。
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