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西亚试剂:新的RNA剪接规律

冷泉港实验室(CSHL)近日发表了一项关于RNA剪接的新研究,这项研究打破了30多年以来对于RNA剪接机制的认识。

在细胞中,编码蛋白质的信息首先从DNA转录成mRNA,mRNA再指导蛋白质合成,但是mRNA并不是DNA的简单复制,DNA最初复制得到的是前体mRNA(pre-messenger RNA),前体mRNA经过剪接编辑过程,剪掉不必要的内含子序列,留下编码蛋白质的外显子,再将这些外显子拼接在一起而得到mRNA。为了使这种“剪切-粘贴”机制能准确无误地进行,在剪接开始时,必须由另一外更小的RNA——U1进行引导,以便正确识别内含子的剪接位点。

在内含子开始端U1识别剪接位点的能力最强,这时U1与目标RNA的配对碱基超过10个,但是在大多数情况下,形成的碱基对较少。在2009年,科学家发现U1甚至能识别表面上不完整的剪接位点,这些位点没有正确匹配RNA的序列。U1不是排队目标内含子RNA序列的第一个碱基,有时能滑到下一个碱基,如果这种移动使更多的U1碱基与目标碱基配对就会产生一个更强的匹配。

现在,他们发现了第二个更普遍的可变选择,它不是从第一个碱基移离,而是U1或其目标上的一个个或多个碱基能凸出来,或从碱基队列脱出,如果这样可使得周围核苷酸产生U1与目标间的较强匹配。

根据对6500个人类基因剪接位点的研究,估计5%的剪接位点用这个"凸起"机制来被识别,这些剪接位点存在于40%的人类基因中。有趣的是,一些非典型识别位点出现在具致病性突变的基因中,其他非典型识别位点是可变剪接发生的位置。

这项研究扩展了U1识别剪接位点的内容,有助于我们更深入地了解内含子的剪接过程,同时有助于我们找出某些能引发疾病的剪接缺陷,为新的治疗方法的产生提供依据