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对于很多使用者而言,R语言作为一种统计学软件是非常优秀的。美国田纳西大学(University of Tennessee in Knoxville)的统计学家Robert Muenchen对各种统计学软件都做过分析,他认为,R语言在统计学方面的功力与SPSS或SAS这些专业化的统计学软件不相上下。近十年来,R语言不仅跟上了统计学软件市场的领头羊,甚至已经取代了它们的地位。据Muenchen介绍,R语言非常有可能在今年夏天的时候成为头号统计学软件。
Bioconductor软件也是一款基于R语言开发的软件,主要应用于基因组学研究领域和分子生物学研究领域。Bioconductor软件能够帮助科研人员对海量的遗传序列数据进行处理和比较,对Gene expression Omnibus等数据库进行检索,或者将数据上传到数据库当中等。该软件包含1000多个软件包,其中有一些软件还可以将数百万个由新一代DNA测序仪产出的DNA片段与已注释基因一一对应起来。
在深入学习R语言的过程中,Royo也在Friedrich Miescher研究所生物信息学组的组长——Michael Stadler的指导下接受了强化训练。Royo花了大约半年来钻研R语言和Bioconductor软件。但是美国加利福尼亚州伯克利数据科学研究所(Berkeley Institute for Data Science in California)的生态学家,rOpenSci组织(该组织旨在帮助科研人员接受并使用R语言,促进R语言的发展)的创始人Karthik Ram认为,还有更多的学习机会。Ram等人会针对科研人员的问题免费教授R语言课程,没有任何编程技巧的人都可以学习。
美国圣地亚哥州立大学(San Diego State University in California)的生态学家Megan Jennings就接受了Ram等人的培训。Jennings跟踪山猫(bobcats)、美洲狮(mountain lions)和其他野生动物,了解它们的运动情况。用了将近一年的时间,使用了36台摄像机,拍摄了40多万张照片,Jennings希望能够在一年的某一个时间跟踪某个动物的活动情况。一开始,Jennings决定用人工挑选照片,并且使用PRESENCE软件处理的方法来完成这项任务。后来在Ram的帮助下,Jennings自己写了一个R语言程序,能够自动识别带标记的照片,并将照片提纯,然后将特定的数据输送给另外一个R语言建模工具。“我以前要花一个小时才能完成的工作,现在只需要5分钟就搞定了。” Jennings介绍道。
R语言最大的优势就是它的在线支持能力。据Muenchen介绍,在统计学论坛中,与R语言相关的问题在所有商业化的统计软件当中名列第一。
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