西亚试剂：数学解决方案

Karline Soetaert是荷兰皇家海洋研究所(Royal Netherlands Institute for Sea Research in Yerseke)的一名海洋学家，她在2008年时想到要对Scheldt河河口里的浮游生物(zooplankton)的健康状况做一番了解。Soetaert想要沿着Scheldt河测算一下这些浮游生物的死亡速度，但是当时还没有相应的R语言软件可供她使用。为了解决这个问题，她与另外两名生态学家使用R语言开发了deSolve软件，这也是第一款使用R语言编写的，能够解微分方程(differential equations)的软件。“其他的软件也可以解决这个问题，但是都非常贵，而且都不是开源软件。” Soetaert着重强调道。现在，deSolve软件已经被广泛使用，比如流行病学家在构建感染性疾病模型时，遗传学家在研究基因调控网络问题时，新药研发人员在了解药物的药代动力学问题时都会用到deSolve软件。

2003年是R语言问世十周年的日子，当时科学家已经开发了200多款不同的R语言软件，而且也出现了第一批引用“R项目(R Project)”的文献。到今天为止，已经诞生了6000多个R语言软件包，可以用来解决各种各样、遍布各个科研领域的问题。其中有些软件，比如Bioconductor(参见go.nature.com/s7mq39)能够帮助科研人员对人类基因组与荷兰人基因组(Neanderthal genome)进行比对;有些软件，比如IPMpack(参见go.nature.com/cyhons)能够对种群增长(population growth)进行建模;有些软件，比如quantmod(参见go.nature.com/jxqasm)能够帮助科研人员预测产权价格(equity prices);还有些软件，比如ggplot2(参见ggplot2.org)能够帮助科研人员使用漂亮的图片将数据结果展示出来。专业人士还能够利用R语言，比如knitr(http://yihui.name/knitr)写出底稿，将原始的数据至于其中，供读者使用。去年在Elsevier出版社的Scopus数据库中，平均在每100篇专业文献当中就大约有1篇文献用到了R语言，或者R语言相关软件，在农业科学和环境科学相关文献中，这个比例会更高，详见附图“R语言的快速上涨趋势”。

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