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西亚试剂:Microbiome science threatened by contamination

在Walker实验室,他们常规采用平衡对照,以检测可能的污染程度。Walker说,他们已经多次在单纯对照实验中发现其他研究报道的所谓阳性结果。他说并不想直接否定这些研究,他们希望这个信息能引起相关学者足够的重视。无独有偶,上个月在PLOS ONE上,美国密歇根大学Richard Lusk小组发表的分析数据也表明,经过稀释的样本也存在污染的危害。Lusk认为两项研究都表明这一问题的严重性,必须采用非常严格的对照实验排除这种干扰,这对于提高研究的严谨性尤其重要。

德国生物医学技术公司Stratec Molecular是提供这类试剂盒的公司,他们说在产品使用说明上已经明确这种产品适用于粪便样本,但不能用于稀释样本的检测。这种PSP粪便DNA 抽提试剂盒不是无菌试剂,也不是无DNA试剂,因此存在一定程度的DNA污染是难以避免的。利用现在的分析技术,任何DNA污染都可以被检测出来。

另外一个德国公司Hilden Qiagen也强调说这种试剂盒不是无DNA的,不能用于稀释的生物样本检测。但是他们认为这类研究对提高研究设计的严格性,重视序列分析中对照实验的重要性很有价值。两家公司都在考虑开发不含DNA污染的试剂盒,虽然在技术上没有障碍,但价格可能会增加许多。也有学者认为,试剂盒只是问题的一个比较重要的方面,其实样本采集、普通的DNA抽提、序列测定等多个过程都可能存在偏差。

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