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蛋白交联是一种特殊的翻译后修饰,在所有生命中起到了基础性的作用,包括建立细胞外基质、调控蛋白在细胞内外的功能或半衰期等。内源蛋白质交联有很多种形式,从相当普遍的二硫键或异肽键,到胶原和弹力蛋白中的特殊连接。
二硫键是许多分泌蛋白必不可少的部分,比如激素、生长因子和细胞表面受体。但分析二硫键一直是个难题。为了精确鉴定通过二硫键相连的多肽,北京师范大学、北京生命科学研究所、中科院计算技术研究所等单位的研究人员开发了一个高通量的质谱方法plink-SS。这一成果发表在二月九日的Nature Methods杂志上。
研究人员以质谱(MS)为基础建立了一个在单个或复杂蛋白质样本中获得二硫键图谱的新方法,包括自动化数据分析和错误发现率(FDR)控制。推荐阅读现在的医药产业亟需一种新工具来分析单克隆抗体中的天然二硫键。研究人员用自己的方法对一个单克隆抗体进行了分析,在可变区鉴定了两种未知二硫键(一个在重链一个在轻链)。为了验证这一方法的有效性,研究人员还将十种标准蛋白混合起来分析。他们通过多重蛋白酶消化,成功获得了所有74个二硫键的图谱。
除此之外,研究人员还进行了蛋白质组水平上的二硫键图谱分析,在大肠杆菌中鉴定了199个二硫键,在人类内皮细胞分泌的蛋白中鉴定了568个二硫键。研究显示,二硫键不仅是一种结构元件,还有着催化和调控功能。许多二硫键涉及了金属结合的半胱氨酸残基,形成这样的二硫键会去除金属离子,改变蛋白质的构象。
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