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值得注意的是,MALAT1的m6A修饰并非直接利用效应蛋白(reader)起作用,却通过改变RNA结构(甲基化作为转换器来改变环结构,促使蛋白与之结合)来间接完成这一通路。这两个步骤可被受到m6A转换控制的变化紧密调控。就在上月,一篇囊括了生物物理学、结构测定和在生物体中探测m6A结构脉络的研究公开发表。该研究揭示了m6A改变二级结构部分的趋向,该二级结构由双链RNA形成,位于单链区域和碱基对区域的交界处,正如MALAT1这一案例中所观测到的一样。
Liu等人继续阐述m6A转换的数量和功能性作用。他们通过观察,看在转录物组(整套转录RNA)中,当m6A水平整体减少时,哪些m6A位点的出现使得HNRNPC结合减少,结果以高置信度确认了2798个位点。接着,他们进一步阐述了HNRNPC和m6A甲基化的连接作用,表明不同细胞的RNA转录多达5251种,它们有的抑制HNRNPC的结合,有的减少m6A的甲基化。作者还通过甲基化、HNRNPC与多种选择性剪接外显子(基因的蛋白编码区域)结合的方式,观察到类似的共调节作用。
上述发现对于我们理解m6A如何控制基因表达而言,是一项巨大的进展,但也留下了许多问题。比如:HNRNPC在m6A甲基化中,是唯一通过此机制被利用的RNA结合蛋白吗,还是另有其它蛋白的参与?Reader蛋白质参与这种m6A转换,这样是进一步降低了二级结构的稳定性呢,还是有助于因子的补充复原?是哪一种细胞变化激发了转换的发生?最后,在庞大的转录物组中,还有其它RNA修饰促使其转换发生吗?在我们看来,恐怕还有更多的问题亟待解决。
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