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西亚试剂:研究人员揭示作物多倍体基因组不对称进化规律

近日,中国农科院油料所和蔬菜花卉所、华大基因研究院联合国内外研究机构,完成了甘蓝基因组测序和分析,并在此基础上与其他近缘种植物基因组比较,发现了作物种间和种内基因组呈现多层次的不对称的进化规律。该研究5月23日在线发表在《自然—通讯》上。

甘蓝项目组技术负责人、中国农科院油料所研究员刘胜毅介绍,甘蓝基因组至少包含45758个蛋白编码基因,与白菜基因组相似,为基因组进化研究提供了良好的模式材料。通过对这组模式材料的分析,研究人员最终揭示出甘蓝和白菜基因组间存在转座子扩增的不对称性、串联重复基因扩增的不对称性、可变剪切数量的不对称性及共线性区外基因丢失率的不对称性,而在种内的亚基因组间存在基因丢失率差异以及亚基因组间同源基因的序列分化、表达分化、可变剪切分化等不对称性进化